MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 plasmid unnamed

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017364	TTA	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017364	ATT	2	6	141	146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385219872
3	NC_017364	AGA	2	6	147	152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219872
4	NC_017364	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	385219872
5	NC_017364	GAAAAA	2	12	295	306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219872
6	NC_017364	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219872
7	NC_017364	ACC	2	6	331	336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385219872
8	NC_017364	TAA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385219872
9	NC_017364	ATTGA	2	10	676	685	40 %	40 %	20 %	0 %	385219872
10	NC_017364	CAA	2	6	750	755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219872
11	NC_017364	CTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385219872
12	NC_017364	AAGA	2	8	1006	1013	75 %	0 %	25 %	0 %	385219872
13	NC_017364	AAACAA	2	12	1090	1101	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385219872
14	NC_017364	AAG	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219872
15	NC_017364	TTGAA	2	10	1205	1214	40 %	40 %	20 %	0 %	385219872
16	NC_017364	ACA	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219872
17	NC_017364	AAC	2	6	1330	1335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219872
18	NC_017364	CAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219872
19	NC_017364	TGTT	2	8	1382	1389	0 %	75 %	25 %	0 %	385219872
20	NC_017364	A	6	6	1405	1410	100 %	0 %	0 %	0 %	385219872
21	NC_017364	AGA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219872
22	NC_017364	TCC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385219872
23	NC_017364	TGA	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219872
24	NC_017364	AAC	3	9	1513	1521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385219872
25	NC_017364	GAA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219872
26	NC_017364	CAAAA	2	10	1760	1769	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017364	A	6	6	1766	1771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017364	A	7	7	1862	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017364	CTA	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017364	AGCG	2	8	1974	1981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017364	A	6	6	2022	2027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017364	A	8	8	2048	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017364	GTT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017364	TTTA	2	8	2081	2088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017364	T	6	6	2110	2115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017364	GC	4	8	2133	2140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017364	AAC	2	6	2169	2174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017364	CTT	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017364	CTT	2	6	2245	2250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017364	CTT	2	6	2267	2272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017364	CTT	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017364	GTGG	2	8	2448	2455	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017364	AGG	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017364	TAG	2	6	2493	2498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017364	TAA	2	6	2550	2555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.